Fondacija dr Zoran Đinđić osnovana je 15. decembra 2003. godine, nakon tragičnog ubistva dr Zorana Đinđića, predsednika Vlade Republike Srbije. U osnivanju Fondacije učestvovali su njegovi najbliži saradnici i prijatelji. Upravitelj Fondacije je gospođa Ružica Đinđić. Fondacija je osnovana sa ciljem da se nastavi sa promocijom vrednosti na kojima je insistirao dr Zoran Đinđić.
Od 2004. godine Fondacija zajedno sa Odborom nemačke privrede za istok i Nemačkom privrednom komorom (Ost-Ausschuss der Deutschen Wirtschaft i Deutsche Industrie - und Handelskammer) učestvuje u sprovođenju programa stipendija "Zoran Đinđić" čiji je cilj da se kvalifikovanim, mladim ljudima obezbedi stručno usavršavanje u najpoznatijim nemačkim kompanijama u trajanju od tri do šest meseci. Stipendije su namenjene studentima završnih godina fakulteta i diplomiranim stručnjacima sa prvim radnim iskustvom. Stučnu praksu studenti obavljaju u nekim od najznačajnijih nemačkih kompanija u oblastima automobilske industrije, energetike, elektrotehnike, elektronike, bankarstva, biznisa, građevinarstva, trgovine, avioinženjeringa, poljoprivredne tehnike, kartografije.
Uz podršku Austrije Fondacija je 2007. godine je započela projekat Iskusiti Evropu - mladi srpski profesionalci u Austriji-program radnih praksi Zoran Đinđić. Projekat je finansiran većim delom od strane Austrijske agencije za razvoj a sprovode ga Fondacija dr Zoran Đinđić i beogradska kancelarija WUS Austrija. Dve stotine studenata i mladih stručnjaka izabrano je da u okviru programa provede tri meseca u Austriji i tako stekne dragoceno iskustvo. Program je završen zbog nedostatka sredstava.
Fondacija dr Zoran Đinđić u saradnji sa Narodnom bibliotekom Srbije započela je i projekat “Izabrana dela dr Zorana Đinđića“. U okviru projekta u narednom periodu biće objavljene tri autorske knjige dr Zorana Đinđića iz oblasti filozofije kao i izabrani članci. Urednici izdanja su Sreten Ugričić i Ružica Đinđić.
Jedan od značajnijih projekata je Virtuelni muzej Zorana Đinđića koji je napravljen u saradnji sa agenciom "Komunis", a pomogle su ga mnoge institucije i mediji. Na internet sajtu Virtuelnog muzeja posetioci mogu da vide lične predmete i beleške Zorana Đinđića, njegove radne prostorije, kao i brojna dokumenta iz njegovog privatnog i profesionalnog života. Virtuelni muzej Zorana Đinđića dizajniran je po uzoru na onlajn muzej posvećen ubijenom američkom predsedniku Džonu Kenediju i biće deo mreže virtuelnih muzeja Evrope. Sadržaj veb sajta je, zahvaljujući pomoći ambasade Nemačke, dostupan i na nemačkom jeziku. Virtuelni muzej Zorana Đinđića mogu posetiti svi zainteresovani građani na adresi www.zorandjindjic.org.
Jedan od najznačajnijih poduhvata Fondacije je i projekat "Škola političke filozofije" započet 2011. godine u saradnji sa Fakultetom političkih nauka a uz pomoć Balkanskog fonda za demokratiju. Fondacija dr Zoran Đinđić je jedna od najmlađih organizacija u Srbiji, ali sa jasnom posvećenošću principima modernog, razvijenog, obrazovanog društva, društva tolerancije i poštovanja različitosti - kulturne i političke. Fondacija je nestranačka i nepolitička organizacija. Ciljevi Škole su: savladavanje osnovnih koncepata političke filozofije i produbljivanje teorijskih znanja iz ove oblasti i kritička analiza političke filozofije dr Zorana Đinđića i uticaja njegove politike na normalizaciju odnosa u regionu. Pravo učešća imaju studenti, diplomirani stručnjaci i postdiplomci iz oblasti društvenih nauka iz Srbije, Hrvatske, Bosne i Hercegovine, Crne Gore i Makedonije. Pored predavanja u okviru škole organizovane su i diskusije, prezentacije knjiga i studijske posete.
